外泌体高通量测序
外泌体(Exosome) 是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡,分布于外周血、 尿液、 唾液、腹水、羊水等体液中。外泌体内含有与细胞来源相关的蛋白质和核酸,可以运输蛋白质、mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA等进入受体细胞,参与细胞间通讯。不同细胞来源的外泌体所含有的蛋白成分和RNA不太相同,通过高通量技术对外泌体 RNA 进行测序,可快速高效获得外泌体 RNA 的全面信息,是疾病诊断和随访的理想手段。
本公司提供外泌体高通量测序和蛋白质组分析:
miRNA高通量测序
lncRNA芯片(人、小鼠)
ceRNA芯片(人、小鼠)
蛋白质组分析(iTRAQ、TMT、Label-free)
miRNA是一类17-24 nt的非编码RNA,能介导基因的转录后沉默,与细胞增殖分化、迁移、疾病发生和疾病进展都有关系。2014年,Goldie等人发现miRNA在外泌体中所占的比例高于外泌体来源细胞,表明miRNA特异地富集于外泌体中。自此,外泌体miRNA的作用受到越来越多的关注:循环的囊泡(如外泌体)被认为是与通过细胞接触或可溶分子转运的信号传导一样重要的第三种细胞间通讯途径。
外泌体miRNA高通量测序服务专业的数据分析:
sRNA注释(分类统计、长度分析);
miRNA成熟体鉴定(miRNA数量与分布、已知miRNA物种分布、miRNA长度分布、碱基偏好性分析);
miRNA表达分布(各样本中miRNA的表达分布、表达相关性散点图、样本间相关性分析);
miRNA差异表达分析(上下调统计图、聚类分析图、火山图、韦恩图)
靶基因富集分析(GO富集分析、KEGG富集分析)
实验流程
- miRNA高通量测序
- 外泌体富集
- RNA提取
- mRNA文库构建与质检
- 上机测序
- 数据分析及报告